Можно было просто обжаловать решение в вышестоящей призывной комиссии, но Вы пошли в суд. Судья не врач и не может разбираться в медицинских вопросах, по этому Вас направили на экспертизу. Если ее предложил провести судья, то экпертиза должна быть бесплатная.

Главное правильно поставить вопросы перед экспертизой:

1. Каким заболеванием я страдаю;

2. Влечет ли данное заболевание нарушение функции 12 ПК;

3. Являюсь ли я ограничено годным.

Так же я не знаю, что Ваш адвокат написал в исковом заявлении "в прошу", я надеюсь там указано признать Вас "ограниченно годным". Если экспертиза Вас признает не годным, то и судья так же и военкомат должен будет выполнить данное решение. Удачи!